En un estudio reciente publicado sobre la medRxiv* servidor de preimpresión, los investigadores presentan evidencia de transmisión comunitaria temprana de la variante Omicron del síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) en Nueva Delhi, India.
Estudiar: Evidencia de transmisión comunitaria temprana de Omicron (B1.1.529) en Delhi: ¡una ciudad con seropositividad muy alta y exposición pasada! Crédito de la imagen: REC Stock Footage / Shutterstock.com
Este artículo de noticias fue una revisión de un informe científico preliminar que no se había sometido a una revisión por pares en el momento de la publicación. Desde su publicación inicial, el informe científico ahora ha sido revisado por pares y aceptado para su publicación en una revista científica. Los enlaces a los informes preliminares y revisados por pares están disponibles en la sección Fuentes al final de este artículo. Ver fuentes
Fondo
La aparición de la variante SARS-CoV-2 Omicron está directamente asociada con un aumento sustancial en el número de casos de enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) en todo el mundo. Sin embargo, todavía no se dispone de información suficiente sobre las características de las infecciones por Omicron de los países en desarrollo.
Nueva Delhi, la capital de la India, tiene una alta tasa de seropositividad al SARS-CoV-2 y experimentó un brote mortal de la variante Delta entre abril de 2021 y junio de 2021. Dado que Delhi también tiene una alta tasa de vacunación contra la COVID-19, la evaluación de la transmisión comunitaria de la variante Omicron en Delhi proporcionaría información valiosa.
Sobre el estudio
En este estudio prospectivo, los investigadores del Departamento de Virología Clínica del Instituto de Ciencias Biliares y del Hígado (ILBS) en Nueva Delhi analizaron todas las muestras respiratorias positivas para la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR) del SARS-CoV-2 recolectadas de cinco distritos de Delhi entre el 25 de noviembre de 2021 y el 23 de diciembre de 2021, utilizando el método de secuenciación del genoma completo (WGS).
Los autores también evaluaron la formación de grupos familiares y la eventual propagación comunitaria de la variante Omicron. El estudio comenzó después de que la Organización Mundial de la Salud (OMS) designara a Omicron como una variante preocupante (COV) del SARS-CoV-2.
La información demográfica y clínica completa de los pacientes infectados con Omicron se obtuvo utilizando el Formulario de referencia de muestras (SRF) del Consejo Indio de Investigación Médica, Nueva Delhi (ICMR) para COVID-19 y la hoja de información del paciente (PIF) enviada desde cada instalación de prueba. Posteriormente, la información faltante sobre los sujetos inscritos se recopiló a través de entrevistas telefónicas.
Hallazgos del estudio
Los hallazgos mostraron que la variante Delta y sus sublinajes B.1.617.2 causaron 182 de los 264 casos de SARS-CoV-2 incluidos en el estudio, mientras que la variante Omicron fue responsable de los 82 restantes. Además, BA.1 y BA. 2 sublinajes representaron el 73,1% y el 26,8% de los casos de Omicron, respectivamente.
Los distritos Sur y Oeste de Delhi tenían la mayor proporción de casos de Delta con 45% y 26%, respectivamente. Más adultos de 18 a 60 años estaban infectados con la variante Delta en comparación con las poblaciones pediátricas o de edad avanzada. En particular, el 80,6 % de los pacientes infectados con Delta estaban completamente vacunados y el 12,9 % tenía antecedentes de COVID-19.
Distribución de linajes y sublinajes de SARS-CoV-2 entre cinco distritos estudiados.
Entre los 91 casos de Delta sintomáticos, 15 requirieron hospitalizaciones, la mayoría de los cuales tenían comorbilidades subyacentes. Dos pacientes infectados con la variante Delta fallecieron durante el período de estudio.
Una edad promedio de 35 años y el sexo masculino se asociaron con una mayor incidencia de infecciones por Omicron. Es importante destacar que el 61 % de los pacientes infectados con Omicron eran asintomáticos y no requerían atención hospitalaria.
Solo tres pacientes infectados con la variante Omicron fueron hospitalizados, dado que tenían hipertensión arterial y diabetes mellitus como comorbilidades subyacentes. Sin embargo, ninguno de los pacientes hospitalizados requirió cuidados intensivos.
Casi el 88 % de los pacientes infectados con Omicron estaban completamente vacunados y el 1,2 % había recibido dos dosis de Moderna y una dosis de las vacunas Covaxin. Los pacientes infectados con Omicron dieron negativo en la RT-PCR en un promedio de 10 días.
De los 82 casos de Omicron, 32 pacientes tenían antecedentes de viajes a áreas de alta seroprevalencia de SARS-CoV-2 o contactos con viajeros y 50 pacientes no mostraron antecedentes de viajes, lo que indica transmisión comunitaria. Casi el 72 % de los pacientes infectados con Omicron con antecedentes de viajes o contacto eran asintomáticos en comparación con el 54 % de los casos de Omicron adquiridos en la comunidad.
Los distritos oeste y sur de Delhi informaron la mayor proporción de casos de Omicron con 40,2% y 26,8%, respectivamente. Se registró una transmisión comunitaria significativa de la variante Omicron del SARS-CoV-2, junto con un aumento pronunciado del 1,8 % al 54 % en la progresión diaria de los casos de Omicron.
Geoetiquetado de casos de Omicron (n=82) de cinco distritos de la capital nacional, Delhi. Los círculos punteados negros representan un grupo local con tres o más casos en las proximidades.
De los 82 casos de Omicron, 38 pertenecían a 14 grupos familiares. Entre estos, solo cuatro familias tenían un historial documentado de viajes internacionales.
De las 10 familias restantes, tres se infectaron con Omicron luego del contacto con un miembro que no era de la familia y que tenía un historial reciente de viajes internacionales. Sin embargo, las infecciones por Omicron en el resto de las siete familias probablemente se asociaron con la transmisión comunitaria de Omicron.
Conclusiones
Según los autores, este es el primer estudio de India que demuestra la evidencia de transmisión comunitaria dirigida por la variante Omicron del SARS-CoV-2 en Delhi. El estudio actual informa una tasa de avance más alta, hospitalización más baja y tasas de infección sintomática de Omicron en individuos con alta seropositividad contra la infección por SARS CoV-2. Además, un cambio definitivo del predominio de la variante SARS-CoV-2 Delta a Omicron también se asoció con esta transmisión comunitaria.
Es posible que el estudio actual no represente la magnitud real de la transmisión comunitaria de Omicron en la capital de la India, ya que se basó en infecciones en solo cinco distritos de Delhi. Por lo tanto, se requieren más estudios con un amplio rango de población para un conocimiento profundo de la epidemiología y el curso clínico de Omicron en la comunidad.
Este artículo de noticias fue una revisión de un informe científico preliminar que no se había sometido a una revisión por pares en el momento de la publicación. Desde su publicación inicial, el informe científico ahora ha sido revisado por pares y aceptado para su publicación en una revista científica. Los enlaces a los informes preliminares y revisados por pares están disponibles en la sección Fuentes al final de este artículo. Ver fuentes
